Soluzzjoni Dijanjostika innovattiva tat-TB u DR-TB minn #Macro & Micro -Test!

Arma Ġdida għad-Djanjosi tat-Tuberkulożi u Sejbien tar-Reżistenza għad-Droga: Sekwenzar Immirat ta' Ġenerazzjoni Ġdida (tNGS) Magħquda ma' Tagħlim Magni għal Dijanjosi ta' Sensittività eċċessiva tat-Tuberkulożi

Rapport tal-letteratura: CCa: mudell dijanjostiku bbażat fuq tNGS u tagħlim tal-magni, li huwa adattat għal nies b'inqas tuberkulożi batterika u meninġite tuberkulosa.

Titolu tat-teżi: Sekwenzar tal-ġenerazzjoni li jmiss immirat għat-tuberkużi u tagħlim tal-magni: strateġija dijanjostika ultra-sensittiva għal tubulari pulmonari paucific u meninġite tubulari.

Perjodiku: 《Clinica Chimica Acta》

JEKK:6.5

Data tal-pubblikazzjoni: Jannar 2024

Flimkien ma 'l-Università ta' l-Akkademja Ċiniża tax-Xjenzi u l-Isptar tas-sider ta 'Beijing ta' l-Università Medika Kapitali, Macro & Micro-Test stabbilixxa mudell ta 'dijanjosi tat-tuberkulożi bbażat fuq il-ġenerazzjoni l-ġdida ta' teknoloġija ta 'sekwenzar immirat (tNGS) u metodu ta' tagħlim bil-magni, li pprovda ultra-għoli sensittività ta 'skoperta għat-tuberkulożi bi ftit batterji u meninġite tuberkulosa, ipprovdiet metodu ġdid ta' dijanjosi ta 'sensittività eċċessiva għad-dijanjosi klinika ta' żewġ tipi ta 'tuberkulożi, u għenet id-dijanjosi preċiża, l-iskoperta tar-reżistenza tad-droga u t-trattament tat-tuberkulożi.Fl-istess ħin, jinstab li l-cfDNA tal-plażma tal-pazjent jista 'jintuża bħala tip ta' kampjun adattat għal kampjunar kliniku fid-dijanjosi ta 'TBM.

F'dan l-istudju, 227 kampjun tal-plażma u kampjun ta 'fluwidu ċerebrospinali ntużaw biex jistabbilixxu żewġ koorti kliniċi, li fihom il-kampjuni tal-koorti dijanjostiċi tal-laboratorju ntużaw biex jistabbilixxu l-mudell ta' tagħlim tal-magni tad-dijanjosi tat-tuberkulożi, u l-kampjuni tal-koorti dijanjostiċi kliniċi ntużaw biex jivverifikaw il-koorti stabbilit. mudell dijanjostiku.Il-kampjuni kollha kienu l-ewwel immirati minn pool ta’ sonda ta’ qbid immirat iddisinjat apposta għal Mycobacterium tuberculosis.Imbagħad, abbażi tad-dejta tas-sekwenzjar TB-tNGS, il-mudell tas-siġra tad-deċiżjonijiet jintuża biex iwettaq validazzjoni inkroċjata ta '5 darbiet fuq is-settijiet ta' taħriġ u validazzjoni tal-kju dijanjostiku tal-laboratorju, u jinkisbu l-limiti dijanjostiċi ta 'kampjuni ta' plażma u kampjuni ta 'fluwidu ċerebrospinali.Il-limitu miksub jinġieb f'żewġ settijiet ta 'test ta' kju ta 'dijanjosi klinika għall-iskoperta, u l-prestazzjoni dijanjostika tal-istudent tiġi evalwata bil-kurva ROC.Fl-aħħarnett, inkiseb il-mudell tad-dijanjosi tat-tuberkulożi.

Fig. 1 dijagramma skematika tad-disinn tar-riċerka

Riżultati: Skont il-limiti speċifiċi tal-kampjun tad-DNA CSF (AUC = 0.974) u l-kampjun cfDNA tal-plażma (AUC = 0.908) determinati f'dan l-istudju, fost 227 kampjun, is-sensittività tal-kampjun CSF kienet 97.01%, l-ispeċifiċità kienet 95.65%, u is-sensittività u l-ispeċifiċità tal-kampjun tal-plażma kienu 82.61% u 86.36%.Fl-analiżi ta '44 kampjun paired ta' plażma cfDNA u fluwidu ċerebrospinali DNA minn pazjenti TBM, l-istrateġija dijanjostika ta 'dan l-istudju għandha konsistenza għolja ta' 90.91% (40/44) fil-plażma cfDNA u fluwidu ċerebrospinali DNA, u s-sensittività hija 95.45% (42/44).Fi tfal bit-tuberkulożi pulmonari, l-istrateġija dijanjostika ta 'dan l-istudju hija aktar sensittiva għall-kampjuni tal-plażma mir-riżultati ta' skoperta Xpert ta 'kampjuni ta' meraq tal-istonku mill-istess pazjenti (28.57% VS 15.38%).

Fig. 2 Prestazzjoni tal-analiżi tal-mudell tad-dijanjosi tat-tuberkulożi għall-kampjuni tal-popolazzjoni

Fig. 3 Riżultati dijanjostiċi ta' kampjuni paired

Konklużjoni: F'dan l-istudju ġie stabbilit metodu dijanjostiku ipersensittiv għat-tuberkulożi, li jista 'jipprovdi għodda dijanjostika bl-ogħla sensittività ta' skoperta għal pazjenti kliniċi b'tuberkulożi oligobaċillari (kultura negattiva).L-iskoperta ta 'tuberkulożi ipersensittiva bbażata fuq cfDNA fil-plażma tista' tkun tip ta 'kampjun adattat għad-dijanjosi ta' tuberkulożi attiva u meninġite tuberkulosa (kampjuni tal-plażma huma aktar faċli biex jinġabru minn fluwidu ċerebrospinali għal pazjenti suspettati ta 'tuberkulożi tal-moħħ).

Link oriġinali: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?via%3Dihub

Introduzzjoni qasira ta 'prodotti ta' skoperta ta 'serje ta' tuberkulosi Macro & Micro-Test

Fid-dawl tas-sitwazzjoni kkumplikata tal-kampjun ta 'pazjenti b'tuberkulożi u bżonnijiet varji, Macro & Micro-Test jipprovdi sett komplut ta' soluzzjonijiet NGS għall-estrazzjoni ta 'likwifikazzjoni minn kampjuni ta' sputum, kostruzzjoni u sekwenzar tal-librerija Qualcomm, u analiżi tad-dejta.Il-prodotti jkopru dijanjosi mgħaġġla ta 'pazjenti b'tuberkulożi, skoperta tar-reżistenza tad-droga tat-tuberkulożi, ittajpjar ta' mycobacterium tuberculosis u NTM, dijanjosi ta 'sensittività eċċessiva ta' tuberkulożi negattiva għal batterji u nies tuberkużi, eċċ.

Kits ta' skoperta serjali għal tuberkulożi u mikobatterji:

Oġġett Nru	isem tal-prodott	kontenut tal-ittestjar tal-prodott	tip ta' kampjun	mudell applikabbli
HWTS-3012	Aġent tar-rilaxx tal-kampjun	Użat fit-trattament ta 'likwifikazzjoni ta' kampjuni ta 'sputum, kiseb numru ta' rekord tal-ewwel klassi, Sutong Machinery Equipment 20230047.	sputum
HWTS-NGS-P00021	Kit ta' skoperta ta' kwantità Qualcomm għal tuberkulożi ipersensittiva (metodu ta' qbid tas-sonda)	Sejbien ta' sensittività eċċessiva mhux invażiva (bijopsija likwida) għal tuberkulożi pulmonari negattiva għall-batterji u noduli tal-moħħ;Il-kampjuni ta 'nies suspettati li huma infettati bit-tuberkulożi jew mikobatterji mhux tuberkulożi ġew analizzati permezz ta' metagenomics ta 'sekwenzjar ta' fond għoli, u l-informazzjoni ta 'sejbien ta' jekk it-tuberkulożi jew il-mikobatterji mhux tat-tuberkulożi ġewx infettati u l-informazzjoni ewlenija tar-reżistenza għall-mediċina tal-ewwel linja tat-tuberkulożi tal-mycobacterium ġew ipprovduti.	Demm periferali, fluwidu tal-ħasil alveolari, hydrothorax u axxite, kampjun tat-titqib tal-fokus, fluwidu ċerebrospinali.	It-tieni ġenerazzjoni
HWTS-NGS-T001	Kit ta' sejbien ta' typing u reżistenza tad-droga ta' Mycobacterium (metodu ta' sekwenzar ta' amplifikazzjoni multiplex)	Mycobacterium typing test, inkluż MTBC u 187 NTM；L-iskoperta tar-reżistenza tad-droga ta 'Mycobacterium tuberculosis tkopri 13-il mediċina u 16-il sit ta' mutazzjoni ċentrali ta 'ġeni ta' reżistenza għad-droga.	Sputum, fluwidu tal-ħasil alveolari, hydrothorax u axxite, kampjun tat-titqib tal-fokus, fluwidu ċerebrospinali.	Pjattaforma doppja tat-tieni/tielet ġenerazzjoni

Punti ewlenin: HWTS-NGS-T001 Kit tat-tajpjar tal-Mycobacterium u l-iskoperta tar-reżistenza tad-droga (metodu ta 'amplifikazzjoni multiplex)

Introduzzjoni tal-prodott

Il-prodott huwa bbażat fuq il-mediċini ewlenin ta 'l-ewwel u t-tieni linja deskritti fil-linji gwida tat-trattament tat-TB tad-WHO, makrolidi u aminoglikożidi użati komunement fil-linji gwida ta' trattament NTM, u s-siti ta 'reżistenza għad-droga jkopru grupp wieħed kollu ta' siti relatati mar-reżistenza tad-droga fil- Katalgu tal-mutazzjoni kumplessa tal-WHO Mycobacterium tuberculosis, kif ukoll ġeni oħra ta 'reżistenza għall-mediċina u siti ta' mutazzjoni skont l-investigazzjoni u l-istatistika ta 'letteraturi ta' punteġġ għoli fid-dar u barra.

L-identifikazzjoni tat-tajping hija bbażata fuq ir-razez NTM miġbura fil-qosor fil-linji gwida NTM ippubblikati minn Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases u l-kunsens ta 'esperti.Il-primers tat-tajpjar iddisinjati jistgħu jamplifikaw, issekwenza u jannotaw aktar minn 190 speċi NTM.

Permezz ta 'teknoloġija ta' amplifikazzjoni tal-PCR multiplex immirat, il-ġeni tal-ġenotipi u l-ġeni reżistenti għall-mediċina ta 'Mycobacterium ġew amplifikati minn PCR multiplex, u nkisbet il-kombinazzjoni tal-amplicon ta' ġeni fil-mira li għandhom jiġu skoperti.Il-prodotti amplifikati jistgħu jinbnew f'libreriji ta 'sekwenzjar ta' produzzjoni għolja tat-tieni ġenerazzjoni jew tat-tielet ġenerazzjoni, u l-pjattaformi kollha ta 'sekwenzjar tat-tieni u t-tielet ġenerazzjoni jistgħu jkunu soġġetti għal sekwenzar ta' fond għoli biex tinkiseb l-informazzjoni tas-sekwenza tal-ġeni fil-mira.Billi tqabbel mal-mutazzjonijiet magħrufa li jinsabu fid-database ta 'referenza integrata (inkluż il-katalgu tal-mutazzjoni tal-kumpless tal-Mycobacterium tuberculosis tal-WHO u r-relazzjoni tiegħu mar-reżistenza għall-mediċina), ġew determinati l-mutazzjonijiet relatati mar-reżistenza għall-mediċina jew is-suxxettibilità ta' mediċini kontra t-tuberkulożi.Flimkien mas-soluzzjoni tat-trattament tal-kampjun tal-isputum li nfetaħ waħedha tal-Macro & Micro-Test, il-problema tal-effiċjenza baxxa tal-amplifikazzjoni tal-aċidu nuklejku tal-kampjuni tal-sputum kliniċi (għaxar darbiet ogħla minn dik tal-metodi tradizzjonali) ġiet solvuta, sabiex is-sejbien tas-sekwenzjar tar-reżistenza tad-droga jistgħu jiġu solvuti applikata direttament għal kampjuni ta' sputum kliniċi.

Firxa ta 'skoperta tal-prodott

34ġeni relatati mar-reżistenza tad-droga ta18mediċini kontra t-tuberkulożi u6Instabu drogi NTM, li jkopru297siti ta' reżistenza għall-mediċini;Għaxar tipi ta 'Mycobacterium tuberculosis u aktar minn190ġew skoperti tipi ta' NTM.

Tabella 1: Informazzjoni ta '18+6 Drogi +190+NTM

Vantaġġ tal-prodott

Adattabilità klinika qawwija: il-kampjuni tal-isputum jistgħu jiġu skoperti direttament b'aġent ta 'awto-likwefazzjoni mingħajr kultura.

L-operazzjoni sperimentali hija sempliċi: l-ewwel rawnd ta 'operazzjoni ta' amplifikazzjoni hija sempliċi, u l-kostruzzjoni tal-librerija titlesta fi 3 sigħat, li ttejjeb l-effiċjenza tax-xogħol.

Ittajpjar komprensiv u reżistenza għad-droga: li jkopru s-siti tat-tajpjar u tar-reżistenza tad-droga ta 'MTB u NTM, li huma l-punti ewlenin ta' tħassib kliniku, ittajpjar preċiż u skoperta tar-reżistenza tad-droga, li jappoġġjaw softwer ta 'analiżi indipendenti, u jiġġeneraw rapporti ta' analiżi bi klikk waħda.

Kompatibilità: kompatibilità tal-prodott, adattament għall-pjattaformi mainstream ILM u MGI/ONT.

Speċifikazzjoni tal-prodott

Kodiċi tal-prodott	isem tal-prodott	Pjattaforma ta 'skoperta	speċifikazzjonijiet
HWTS-NGS-T001	Kit tat-tajpjar tal-mycobacterium u ta' l-iskoperta tar-reżistenza tad-droga (metodu ta' amplifikazzjoni multiplex)	ONT、Illumina、MGI、Salus pro	16/96rxn