Studju metagenomiku reċenti żvela spettru notevolment divers ta' viruses u batterji li jinġarru minn annimali gerriema fil-Provinċja ta' Heilongjiang, inkluż il-virus Lassa, il-virus Amur, Salmonella, u Yersinia pestis.
Ir-riċerka użat il-Kit ta' Arrikkiment tal-RNA tal-Patoġeni minn Macro & Micro-Test, ibbażat fuq teknoloġija ta' qbid ta' sondi. Billi naqqas b'mod selettiv l-rRNA ospitanti u frammenti oħra konservati tal-ospitanti, il-metodu żamm b'mod effettiv l-RNA mikrobjali, u b'hekk tejjeb b'mod sinifikanti s-sensittività għad-detezzjoni tal-patoġeni. Dan il-pass ta' arrikkiment tal-RNA tal-patoġeni kien kritiku biex tinkiseb rata għolja ta' detezzjoni u pprovda appoġġ tekniku qawwi għas-sorveljanza tal-patoġeni.
Rodenti: Riżervi Ewlenin ta' Mard Żoonotiku
Il-ġrieden huma l-grupp ta' mammiferi l-aktar rikk fl-ispeċi u mifrux b'mod wiesa', li jinkludi aktar minn 2,000 speċi madwar id-dinja u jammontaw għal aktar minn 40% tal-ispeċi kollha ta' mammiferi.
Lil hinn mill-importanza ekoloġika tagħhom, il-ġrieden iservu bħala riżervi u vetturi ewlenin ta' bosta patoġeni żoonotiċi.Minħabba li l-ħabitats tal-annimali gerriema ta' spiss jikkoinċidu mal-ambjenti umani—permezz ta' gdim dirett, kuntatt mal-eskrementi, jew trasmissjoni indiretta permezz ta' briegħed u dud—il-patoġeni li jospitaw joħolqu theddid persistenti għas-saħħa pubblika.
Ta' min jinnota li aktar minn 70% tal-mard infettiv emerġenti joriġina mill-ħajja selvaġġa, bil-ġrieden jirrappreżentaw wieħed mill-aktar riżervi virali sinifikanti.
Reġjun tal-Fruntiera ta' Heilongjiang: Linja ta' Quddiem għas-Sorveljanza tal-Patoġeni
Heilongjiang, provinċja tal-fruntiera fil-Grigal taċ-Ċina, tippossjedi riżorsi ekoloġiċi abbundanti u taqsam fruntieri ma' diversi pajjiżi. Il-kombinazzjoni ta' bijodiversità rikka u moviment frekwenti tal-popolazzjoni transkonfinali toħloq kundizzjonijiet favorevoli għat-trażmissjoni ta' patoġeni.
Bejn Ġunju u Lulju 2021, ir-riċerkaturi ġabru 67 annimal gerriema selvaġġ mill-Belt ta' Hengdaohezi, fil-Belt ta' Mudanjiang. Il-kampjuni inkludew:
l 20Apodemus peninsulae
l 47Myodes rufocanus
L-eżemplari kollha nqabdu f'żoni residenzjali u artijiet agrikoli tal-madwar, u dan jenfasizza l-interfaċċja mill-qrib bejn l-insedjamenti umani u l-ħabitats tal-ħajja selvaġġa.
Teknoloġija tal-Arrikkiment tal-Patoġeni: Negħlbu l-Interferenza fl-Isfond tal-Ospitanti
Fis-sekwenzar metagenomiku, l-RNA ospitanti tipikament jiddomina l-qari tas-sekwenzar, u jaħbi sinjali ta' patoġeni b'abbundanza baxxa.
Biex tindirizza din l-isfida, l-istudju użaKit ta' Sejbien Metaġenomika tal-Patoġeni ta' Macro & Micro-Test. Bl-użu tat-teknoloġija tal-qbid tal-probe, sondi ddisinjati speċifikament jorbtu mal-rRNA ospitanti u ma' sekwenzi konservati, u b'hekk jippermettu t-tnaqqis tagħhom u b'hekk jarrikkixxu l-RNA mikrobjali.
Dan l-approċċ tejjeb sostanzjalment is-sensittività tal-iskoperta tal-patoġeni, u b'hekk ippermetta li s-sekwenzar downstream jirkupra proporzjon ogħla ta' qari ta' patoġeni. Il-pass ta' arrikkiment poġġa bażi soda għall-karatterizzazzjoni preċiża tal-ispettru tal-patoġeni li jinġarru mill-ġrieden.
Wara l-arrikkiment, il-kampjuni tal-RNA għaddew minn traskrizzjoni inversa, kostruzzjoni ta' librerija, u sekwenzar b'rendiment għoli. L-analiżi bijoinformatika inkludiet:
l Filtrazzjoni tal-ġenoma tal-ospitant
Klassifikazzjoni tassonomika bl-użu ta' Kraken2
l Korrezzjoni tal-abbundanza bil-Bracken
Dan il-fluss tax-xogħol iġġenera profil komprensiv ta' komunitajiet virali u batteriċi.
Sejbiet tar-Riċerka: Ko-ċirkolazzjoni ta' Viruses u Batterji Multipli
Sejbiet Virali
Il-viruses li nstabu kienu jappartjenu għal 21 familja virali, inklużiArenaviridaeuHantaviridae.
Permezz ta'de novoPermezz ta' assemblaġġ bl-użu ta' Megahit, ġew iġġenerati 154 contig virali, li minnhom 110 kienu allinjati ma' 19-il virus minn tmien familji.
In Apodemus peninsulae, ġew identifikati l-vajrusis li ġejjin:
l Arenaviruses: virus Lassa, virus Wenzhou, virus Gairo
l Hantaviruses: virus Amur, virus Puumala
In Myodes rufocanus, Instabu l-arterivirus tal-firien u l-virus tal-Amur.
Fost dawn il-patoġeni:
Il-virus Lassa huwa aġent kawżattiv tad-deni emorraġiku virali, b'rati ta' fatalità tal-każijiet li jilħqu madwar 20%.
Il-virus Amur huwa wieħed mill-patoġeni responsabbli għad-deni emorraġiku b'sindromu renali (HFRS). Iċ-Ċina tirrapporta l-ogħla piż globali ta' infezzjonijiet tal-hantavirus.
Sejbiet Batterjali
Ġew annotati total ta' 1,051 ġeneru batterjali.
L-aktar ġeneri abbundanti kienu:
lSalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Salmonellahuwa patoġenu ewlieni li jinġarr mill-ikel, responsabbli għal madwar 9 miljun każ ta' deni tifojde u madwar 110,000 mewta kull sena madwar id-dinja.
Yersinia pestis, l-aġent kawżattiv tal-pesta, kien responsabbli għal tliet pandemiji storiċi. Il-Provinċja ta' Heilongjiang hija rikonoxxuta bħala wieħed mill-foki naturali tal-pesta fiċ-Ċina u tibqa' reġjun ta' prijorità għas-sorveljanza tal-pesta.
Sinifikat tal-Istudju
Kontribuzzjonijiet Xjentifiċi
Dan l-istudju jirrappreżenta l-ewwel rapport ta' frammenti tal-virus Lassa u l-virus tal-arterite tal-firien f'annimali gerriema minn Heilongjiang, u b'hekk jespandi d-database tal-patoġeni li jinġarru mill-annimali gerriema taċ-Ċina.
Jikkaratterizza sistematikament komunitajiet virali u batterjali f'popolazzjonijiet lokali ta' annimali gerriema, u jipprovdi dejta bażi għas-sorveljanza ta' mard żoonotiku f'reġjuni tal-fruntiera.
Implikazzjonijiet għas-Saħħa Pubblika
Is-sejbiet jenfasizzaw il-ħtieġa għal sorveljanza kontinwa u skrinjar tal-patoġeni ta'A. peninsulaeuM. rufocanus.
Id-dejta tipprovdi evidenza xjentifika li tappoġġja strateġiji ta' kontroll tas-sors għal mard bħall-pesta u d-deni emorraġiku b'sindromu renali.
Qawwiet Metodoloġiċi
Is-sekwenzar metaġenomiku jippermetti skoperta imparzjali kemm ta' patoġeni magħrufa kif ukoll ta' patoġeni ġodda.
F'dan l-istudju, it-teknoloġija tal-arrikkiment tal-patoġeni ta' Macro & Micro-Test uriet prestazzjoni qawwija, u tejbet b'mod effettiv id-detezzjoni tal-patoġeni fil-mira f'kampjuni bijoloġiċi kumplessi. Ir-riżultati jikkonfermaw il-kapaċità tagħha li tappoġġja l-identifikazzjoni ta' patoġeni b'sensittività għolja fis-sorveljanza tal-ħajja selvaġġa.
Rakkomandazzjoni tal-Prodott
Abbażi tal-applikazzjoni b'suċċess tiegħu f'dan l-istudju, il-Macro & Micro-Test Pathogen RNA Enrichment Kit huwa rakkomandat ħafna għar-riċerka ta' sorveljanza metagenomika.
Billi jnaqqas b'mod effiċjenti l-aċidi nuklejċi tal-ospitanti u jarrikkixxi s-sekwenzi mikrobjali, il-kit itejjeb b'mod sinifikanti s-sensittività tad-detezzjoni u l-kwalità tad-dejta. Jirrappreżenta għodda essenzjali għall-iskoperta preċiża tal-patoġeni f'kampjuni kumplessi u jipprovdi appoġġ tekniku robust għas-sorveljanza tas-saħħa pubblika, il-valutazzjoni tar-riskju żoonotiku, u t-tħejjija għat-tifqigħat.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Ħin tal-posta: 02 ta' Marzu 2026